Insekter
Sommerfugler
Øya Østre Bolæren er registrert som en «hot-spot» for sommerfugler. Registreringer viser over 900 ulike arter. Det finnes også observasjoner av sjeldne arter på andre øyer i nasjonalparken. Noen eksempler på sjeldne arter er prikkrutevinge (CR), karminspinner (VU), engglassvinge (NT) og Alexis blåvinge (NT).
Edderkopper
I nasjonalparken finner vi også mange småkryp, og også her registreres det stadig nye. Sandø regnes som en «hot-spot» for edderkopper og biller. Taregråedderkoppen (EN) overvåkes årlig, den finnes litt høyt oppe i tangvollene, ofte sørvendt. Storbladskjærerbie (CR) finnes også i nasjonalparken sittende på fagerknoppurt. Strandmaurløve (EN) er registrert på Sandø. Leveområdene er lett gjengjennelig ved de karakteristiske gropene i sanda.
Andre arter
Det er registrert mange sjeldne arter i Færder nasjonalpark. I forvaltningsplanen, vedlegg 7 finnes en liste over rødlistearter på land og i sjø. Noen eksempler på rødlistede arter er blant annet sørlig metallvann-nymfe (VU), sto-keiserlibelle, som er en av Europas største øyenstikkere. Andre spennende arter er kobberpraktbille (VU), storbladskjærerbie som trives på fagerknoppurt og den artige bladlusa Stomaphis wojciechowskii (andre funn i Norge på Mellom-Bolæren).
